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[導(dǎo)讀] 存儲可以在很多方面為醫(yī)學(xué)研究提供支持,尤其是與大腦成像硬件相關(guān)的領(lǐng)域。美國斯坦福大學(xué)的 MultiMAP 項目則利用高速存儲跟蹤、記錄并分析斑馬魚大腦中神經(jīng)細(xì)胞的活動。

 存儲可以在很多方面為醫(yī)學(xué)研究提供支持,尤其是與大腦成像硬件相關(guān)的領(lǐng)域。美國斯坦福大學(xué)的 MultiMAP 項目則利用高速存儲跟蹤、記錄并分析斑馬魚大腦中神經(jīng)細(xì)胞的活動。

 


 

斯坦福大學(xué)的 MultiMAP 是什么?

科學(xué)作家 Bruce Goldman 解釋說,MultiMAP(分子和活動表型的多重比對)支持研究人員“跟蹤斑馬魚大腦中的幾乎每一個神經(jīng)元,然后確定每個相關(guān)神經(jīng)元的細(xì)胞類型。”MultiMAP 背后的斯坦福大學(xué)團隊利用技術(shù)確定了腦回路實際上與警覺性有關(guān)。

斯坦福大學(xué)生物工程及精神病學(xué)和行為科學(xué)教授兼霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員 Karl Deisseroth 告訴 Goldman,“我們在魚存活期、細(xì)胞處于極度活躍狀態(tài)時跟蹤它大腦中的每個神經(jīng)元,并了解了魚的警覺性最高時哪些細(xì)胞最活躍。然后,在不改變魚頭部細(xì)胞相對位置的情況下使用固定劑保存魚的腦組織后,我們可以使用分子探針找到相關(guān)神經(jīng)元并確定其細(xì)胞類型。”

 


 

斯坦福大學(xué)跟蹤了斑馬魚大腦中的神經(jīng)元,將大腦活動與警覺性聯(lián)系起來

圖片來自 NICHD

這項技術(shù)本身需要大規(guī)模運作,因此需要處理單元附近部署大量低延遲、高速的存儲才能實現(xiàn)正常運轉(zhuǎn)。隨著此類大腦成像技術(shù)的持續(xù)發(fā)展和進步,存儲也要迎頭趕上。

睡不好可能是因為警覺性低?

MultiMAP 極其重要,因為它收集的數(shù)據(jù)對心理健康有極大影響。Goldman 特別指出,睡眠不足與抑郁癥均和缺乏警覺性有關(guān),而焦慮癥、躁狂癥與創(chuàng)傷后壓力心理障礙癥 (PTSD) 和警覺性過度有關(guān)。

Deisseroth 說:“新發(fā)現(xiàn)開拓了一條全新的深入探索之路。我們越了解警覺性等大腦狀態(tài)下的神經(jīng)元構(gòu)造,就會越了解大腦狀態(tài)這個概念本身,我們甚至能夠幫助設(shè)計針對大腦狀態(tài)的臨床干預(yù)措施。”

要踏上這條“深入探索之路”,快速存儲至關(guān)重要。斑馬魚幼體有大約 100,000 個神經(jīng)元,每個神經(jīng)元產(chǎn)生的數(shù)據(jù)都需要被記錄、存儲并快速仔細(xì)地梳理,才能獲取重要的數(shù)據(jù)點。成年斑馬魚有大約 1,000 萬個神經(jīng)元,這對斯坦福大學(xué)的 MultiMAP 技術(shù)的要求呈指數(shù)級增長。相較之下,人類大腦則包含 860 億個神經(jīng)元。

 


 

人類的神經(jīng)元數(shù)目是斑馬魚的 860 多倍

哪類存儲能夠繪制大腦構(gòu)造呢?

美光科技技術(shù)營銷高級經(jīng)理 Jason Echols 表示,在處理如此多的信息、繪制大腦構(gòu)造并確定其決策和功能時,研究人員便進入了快速數(shù)據(jù)領(lǐng)域。為了處理如此多的數(shù)據(jù)并分析其中的重要數(shù)據(jù)點,MultiMAP“讓人工智能和機器學(xué)習(xí)變得稍稍清晰可見了一些”。

Echols 說,“他們需要進行大量的并行處理。當(dāng)他們需要將數(shù)據(jù)納入決策流時,他們不僅僅是在思考,實際上是在提取數(shù)據(jù)并予以分析。”從事 MultiMAP 項目等工作的醫(yī)學(xué)研究人員在竭力“優(yōu)化存儲基礎(chǔ)設(shè)施以獲取最佳性能”,尤其是當(dāng)他們處理斯坦福大學(xué)研究人員在腦細(xì)胞中觀察到的海量數(shù)據(jù)時。

“英偉達和其他一些企業(yè)都在這些領(lǐng)域與他們進行合作。”Echols 說,“他們?nèi)绾问勾鎯婢叱杀拘б婧统焖俣?,讓運行這些數(shù)據(jù)所需的所有計算核心都能獲得需要的數(shù)據(jù)呢?這才是真正有意義的對話。”

精簡存儲是解決之道

隨著精簡、快速且高效的存儲解決方案不斷在新應(yīng)用中實施,這一領(lǐng)域的方方面面均將受益。其中有八種應(yīng)用正推動著前沿科學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展:

大數(shù)據(jù)與分析

物聯(lián)網(wǎng) (IoT) 設(shè)備

混合云

非易失性存儲主機控制器接口規(guī)范 (NVMe) 和單根輸入/輸出虛擬化 (SRIOV)

橫向擴展架構(gòu)

人工智能 (AI) 和機器學(xué)習(xí)

安防

軟件定義的存儲 (SDS)

美光科技首席技術(shù)營銷工程師 Tony Ansley 表示,上述很多應(yīng)用均能從與精簡存儲這一基本概念中獲益:更快速地存儲和計算數(shù)據(jù)。比如說,如果研究人員可以判斷某個神經(jīng)元是處于活躍狀態(tài)還是不太活躍狀態(tài),他們就能更快速地得出結(jié)論。

Ansley 說,“它不僅是存儲技術(shù),也是整個計算機行業(yè)的架構(gòu)技術(shù)。如何針對新興的服務(wù)器平臺、服務(wù)器技術(shù)和處理器技術(shù)的需求優(yōu)化存儲,使我們能夠在更小的整體空間內(nèi)確保更多的存儲容量和更快的存儲速度,從而提高分析速度呢?”

 


 

Crucial DDR4 DRAM 等美光內(nèi)存產(chǎn)品能幫助醫(yī)學(xué)研究技術(shù)縮短處理時間

圖片來自 Dsimic

在計算架構(gòu)上直接分析數(shù)據(jù)大約需要 5 納秒來完成處理。就處理時間而言,DRAM 與計算架構(gòu)極其接近,需要約 30 納秒。但隨著內(nèi)存解決方案越來越遠(yuǎn)離計算架構(gòu),處理時間也隨之增加。SATA 固態(tài)硬盤處理同樣的數(shù)據(jù)需要 300 微秒,而 SAS 普通硬盤需要 6 毫秒。在遙遠(yuǎn)的另一端,混合 SAN 需要整整 30 毫秒。

換言之,如果在計算架構(gòu)中直接處理數(shù)據(jù)需要 1 秒,那么 DRAM 處理同樣的數(shù)據(jù)需要 6秒。SATA 固態(tài)硬盤需要 16 個小時,SAS 普通硬盤需要 2 周,而混合 SAN 需要 2-3 個月。在這個層面,Echols 說:“這些速度極快的計算架構(gòu)等不了那么久。”

把數(shù)據(jù)握在手里

Ansley 表示,美光科技助力精簡醫(yī)學(xué)研究技術(shù)的一個主要方式是:在更小的外形規(guī)格內(nèi)實施存儲解決方案,方便研究人員隨身攜帶。尤其是在可能爆發(fā)特定類型病原體的第三世界國家/地區(qū),研究人員可能需要收集實時視頻掃描或超聲波掃描,即大量數(shù)據(jù)需要處理。

 


 

Tony Ansley 認(rèn)為,美光科技的內(nèi)存產(chǎn)品非常適合用來為移動醫(yī)療設(shè)備提供支持

圖片來自哥倫布空軍基地

就像 MultiMAP 收集來自每個大腦神經(jīng)元的數(shù)據(jù)一樣,其他醫(yī)學(xué)技術(shù)也會收集海量數(shù)據(jù),從高分辨率的X射線圖到超聲波掃描圖文件中的數(shù)千兆字節(jié)的數(shù)據(jù),均是如此。研究人員需要能在現(xiàn)場隨時輕松獲取更多的數(shù)據(jù),避免不斷上傳和下載。因此,Ansley 說:“如果能將所有技術(shù)更高效地集成到越來越小的封裝中,我就能夠用手拿著而不用背在背上。”

他接著說道:“作為行業(yè)的一份子,美光科技始終在考慮如何將更多存儲集成到單個 NAND芯片中。我們將 2.5 英寸硬盤或固態(tài)硬盤的存儲從過去的 100GB 擴展到了 10 到 20TB,而這僅用了短短幾年的時間,我們還將繼續(xù)努力。”

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