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[導讀] 廣州2021年12月7日 /美通社/ -- 12月1日,基準醫(yī)療與南開大學聯(lián)合共建的醫(yī)學數(shù)據(jù)研究中心提交的重量級學術論文《Noninvasive Lung Cancer Early Detection via Deep Methyla...

基準醫(yī)療“DeepMeth甲基化數(shù)據(jù)處理AI模型”從近萬份研究中脫穎而出,被國際頂級人工智能學術會議AAAI'22收錄

廣州2021年12月7日 /美通社/ -- 12月1日,基準醫(yī)療南開大學聯(lián)合共建的醫(yī)學數(shù)據(jù)研究中心提交的重量級學術論文Noninvasive Lung Cancer Early Detection via Deep Methylation Representation Learning》人工智能促進協(xié)會AAAI(Association for the Advancement of Artificial Intelligence)下屬的全球人工智能頂級學術會議,第36屆AAAI'22(會議時間:2022年2月22日-3月1日,溫哥華)收錄。本次會議共收到9251篇投稿,創(chuàng)下AAAI投稿量的歷史紀錄;最終接收1349篇論文,錄取率為15.0%,創(chuàng)歷史新低。

基準醫(yī)療基于AI深度學習(Deep Learning)的DeepMeth甲基化數(shù)據(jù)處理模型全球首個基于深度學習通過連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域算法,也是基準醫(yī)療肺癌早檢產(chǎn)品PulmoSeekTM Plus核心算法基礎。此次基準醫(yī)療DeepMeth研究工作能從近萬份研究論文中脫穎而出,是世界AI學術界對基準醫(yī)療在腫瘤早診早篩領域的工作的高度認可,也是精準醫(yī)療AI+癌癥交叉學科領域的一個令人振奮的消息,再加上早前PulmoSeekTM肺癌早檢甲基化液體活檢模型已在國際重要學術期刊The Journal of Clinical Investigation》發(fā)表,多項國際學術權威機構的認可奠定了基準醫(yī)療全球肺癌早檢領域當之無愧的技術領先地。

請參照下文對這項算法的解讀:

突圍之路,破局ctDNA甲基化早檢臨床應用瓶頸

血漿樣本中低豐度的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)一直是癌癥早檢的難點。南開大學計算機學院與基準醫(yī)療的醫(yī)學數(shù)據(jù)研究中心聯(lián)合攻關,歷經(jīng)數(shù)年,首次利用深度學習連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域的算法,強化了甲基化區(qū)域的整體性和連續(xù)性,成功開發(fā)了“深度甲基化表示學習進行無創(chuàng)肺癌早期檢測的DeepMeth”核心技術,一舉突破這個重大的學術和產(chǎn)業(yè)難關。

精準錨定,探秘CpG 位點的豐富遺傳學信息

不同于現(xiàn)有指標通常僅表示每個區(qū)域甲基化位點的頻率、忽略甲基化CpG位點的定位和甲基化模式,而這些正是癌癥檢測的預測特征;DeepMeth獨立看待每個甲基化區(qū)域并開發(fā)出自動編碼器來學習隱藏在區(qū)域布局中的豐富信息(例如,甲基化 CpG 位點的位置和共甲基化區(qū)域)。這是世界上首次用連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域的深度學習模型研究,可以很大程度上避免甲基化檢測的維度災難。

深度驗證,普及肺癌早檢臨床應用

DeepMeth算法模型已在全國14家醫(yī)院多中心臨床數(shù)據(jù)集上評估了檢測性能:與基線相比,DeepMeth實現(xiàn)了顯著的AUC提升;并可與傳統(tǒng)的臨床檢查指標相結合,提高整體檢測的準確度。自2020年4月以來,全國已有94家醫(yī)院使用了基于DeepMeth模型的PulmoSeekTM Plus產(chǎn)品(用于早期肺癌檢測)。

基準醫(yī)療始終堅持從“衛(wèi)生經(jīng)濟學的角度”出發(fā),本著“以患者利益為本”的初心,在技術上精耕不輟、厚積薄發(fā),不斷優(yōu)化產(chǎn)品性能,提高性價比,將癌癥早期診斷整體解決方案落到實處,最終惠及更多有需要的普通人群。

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