據(jù)物理學家組織網(wǎng)6月20日（北京時間）報道，多年來，科學家一直依靠靜態(tài)的圖像來了解導致癌癥復發(fā)的關(guān)鍵蛋白?，F(xiàn)在，美國南方衛(wèi)理公會大學（SMU）的生物化學家另辟蹊徑，為人體P糖蛋白（P-glycoprotein）構(gòu)建了動態(tài)的三維計算機結(jié)構(gòu)模型，使其能更直觀地顯示P糖蛋白的工作原理，這有助于改進阻止癌癥復發(fā)的化學療法。相關(guān)研究報告發(fā)表在《生物化學》雜志的網(wǎng)絡版上。

美研究改進阻止癌癥復發(fā)化療技術(shù)

P糖蛋白又被稱之為多藥耐藥性蛋白，很多化療藥物不起作用都與其有關(guān)。P糖蛋白能夠自發(fā)地從細胞內(nèi)吸出毒素，但當癌癥細胞表達出比正常細胞更多的P糖蛋白時，化療藥物將不再有效，因為P糖蛋白會把它當作毒素，在其摧毀癌細胞之前將其抽出。

該校生物科學系的副教授約翰·懷斯表示：“我們正在找尋一些能臨時抑制抽吸作用的小分子，一種能夠保持化療化合物存在直至其殺死癌細胞的安全、有效的新藥。”

科研人員通過進化關(guān)系和有關(guān)P糖蛋白組成的科學知識，推斷出了人類P糖蛋白的結(jié)構(gòu)。并利用計算機模型，動態(tài)模擬展示了這種蛋白的抽吸動作。他們基于囊括了2100萬可商購化合物的ZINC數(shù)據(jù)庫展開了模擬篩查，其每天可借助SMU的高效計算機篩選大概4萬種化合物。懷斯等人還能在計算機中構(gòu)建這些化合物分子，并將溫度提升至37攝氏度以模擬人體環(huán)境，或是保持適當?shù)柠}分和其他適宜的環(huán)境等，就像在實際的實驗中一樣，從而營造出可遵循物理定律和生物化學原理移動的三維模型。借助這種方式，科學家能看到化合物如何與蛋白發(fā)生動態(tài)的相互作用，而不僅僅是靜態(tài)的快照。

研究人員稱，新的模型是一種功能強大的發(fā)現(xiàn)工具，尤其是與高效的超級計算共同作用時效果更好。他們已經(jīng)利用動態(tài)的三維模型篩選了超過800萬的潛在藥物化合物，并對有希望成功制止化療失敗的幾百種進行了測試。結(jié)果顯示，其中有少數(shù)化合物能夠抑制P糖蛋白的抽吸機制。下一步，他們還將回溯至三維計算機模型，繼續(xù)找尋類似的化合物，但其最終是否能制成抗癌藥物仍有待檢驗。

懷斯談到，這是一種良好的原理驗證，在計算模型中運行化合物能夠快速、經(jīng)濟而有效地從大量化合物中篩選出可進行測試的藥物，這將為找到允許化療化合物進入體內(nèi)并摧毀癌細胞的潛在新型藥物鋪平道路。

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