AT89S5x系列單片機支持對片內Flash存儲器在線編程(ISP)。ISP是指在電路板上的被編程的空白器件可以直接寫入程序代碼，而不需要從電路板上取下器件，已經編程的器件也可以用ISP方式擦除或再編程。

ISP下載編程器可以自行制作，也可電子市場購買。

ISP下載編程器與單片機一端連接的端口通常采用ATMEL公司提供的接口標準，即10引腳的IDC端口。下圖為IDC端口的實物圖以及端口的定義。采用ISP下載程序時，用戶目標板上必須裝有上述IDC端口，端口中個信號線必須與目標板上AT89S51的對應引腳連接。注意，圖中的8腳Pl.4（SS（的反））端只是對AT89LP系列單片機有效，對AT89S5x系列單片機無效，不用連接即可。

常見市售的ISP下載型編程器為ISPro下載型編程器。購買ISPro下載型編程器時，會隨機贈送安裝光盤。用戶將安裝光盤插入光驅，運行安裝程序SETUP. exe即可。安裝后，在桌面上建立一個“ISPro. exe下載型編程器”圖標，雙擊該圖標，即可啟動編程軟件。ISPro下載型編程器軟件的使用與RF-810軟件的使用方法基本相同，這里不再進行具體介紹。用戶使用時，可參照編程器使用說明書進行操作。

上面介紹了兩種程序下載的方法，就單片機的發(fā)展方向而言，已經趨向于ISP程序下載方式，一方面由于原有不支持ISP下載的芯片逐漸被淘汰（大部分已經停產），另一方面ISP使用起來十分方便，而不用增加太多的成本就可以實現程序的下載，所以ISP下載方式已經逐步成為主流。