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[導(dǎo)讀] (文章來(lái)源:人人都是產(chǎn)品經(jīng)理) 通常的圖像分類任務(wù)動(dòng)輒幾十萬(wàn)、上百萬(wàn),甚至上千萬(wàn)的數(shù)據(jù)量相比,醫(yī)療影像它的數(shù)據(jù)量是非常少的。同時(shí),由于設(shè)備參數(shù)、醫(yī)生的拍照手法或拍攝角度、光照的明暗不同,

(文章來(lái)源:人人都是產(chǎn)品經(jīng)理)

通常的圖像分類任務(wù)動(dòng)輒幾十萬(wàn)、上百萬(wàn),甚至上千萬(wàn)的數(shù)據(jù)量相比,醫(yī)療影像它的數(shù)據(jù)量是非常少的。同時(shí),由于設(shè)備參數(shù)、醫(yī)生的拍照手法或拍攝角度、光照的明暗不同,食管的表觀變化非常復(fù)雜。那么,我們?cè)鯓硬拍茉谶@樣的條件下得到一個(gè)可靠穩(wěn)定的模型?

采用Feature map。Feature Map是卷積核卷出來(lái)的,你用各種情況下的卷積核去乘以原圖,會(huì)得到各種各樣的feature map。你可以理解為你從多個(gè)角度去分析圖片。而不同的特征提?。ê耍?huì)提取不同的feature,模型想要達(dá)成的目的是解一個(gè)最優(yōu)化,來(lái)找到能解釋現(xiàn)象的最佳的一組卷積核。

在同一層,我們希望得到對(duì)于一張圖片多種角度的描述,具體來(lái)講就是用多種不同的卷積核對(duì)圖像進(jìn)行卷,得到不同核(這里的核可以理解為描述)上的響應(yīng),作為圖像的特征。他們的聯(lián)系在于形成圖像在同一層次不同基上的描述。下層的核主要是一些簡(jiǎn)單的邊緣檢測(cè)器(也可以理解為生理學(xué)上的simple cell)。

在拿到食管數(shù)據(jù)之后,如何判別這個(gè)食管屬于健康正常食管還是病變食管呢?當(dāng)我們判斷一個(gè)食管是否異常食管時(shí),只需要找到一個(gè)病變區(qū)域,就能夠說(shuō)明這個(gè)食管是異常的。但是反過(guò)來(lái),在正常圖像中,并不能說(shuō)找到一個(gè)正常特征,就說(shuō)明這個(gè)食管是正常的。只能說(shuō)在這張圖像中我們沒(méi)有找到異常特征,它可能是見(jiàn)正常的。

因此,在正常特征和異常特征之間,我們更傾向于提取病變特征,抑制正常特征。病變和正常的case都會(huì)經(jīng)過(guò)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),以得到特征向量。對(duì)于這個(gè)向量,我們希望盡可能凸顯異常特征,讓正常特征趨近于0。我們是如何把這種信息建模到模型中的呢?我們對(duì)模型進(jìn)行了重新建模,最后準(zhǔn)確率大概在97%左右。前面的模型相對(duì)來(lái)說(shuō)比較簡(jiǎn)單,第三個(gè)模型主要是區(qū)分炎癥和癌癥,它與前兩個(gè)問(wèn)題不大一樣。

一般情況下,病變的食管圖像里都會(huì)伴隨著一些炎癥的特征。我們對(duì)癌癥的判斷往往是通過(guò)一個(gè)紋理特別小的區(qū)域得出的,因此需要提取出更加精細(xì)化的特征。比較好的做法就是讓很多專家把病灶區(qū)非常嚴(yán)謹(jǐn)?shù)貥?biāo)注出來(lái),這樣我們只需要對(duì)這個(gè)區(qū)域進(jìn)行識(shí)別就好了。這個(gè)標(biāo)注量非常大,因此數(shù)據(jù)異常匱乏。我們沒(méi)有癌癥區(qū)域的標(biāo)注數(shù)據(jù),但又希望得到非常精細(xì)化的特征,如何解決這個(gè)矛盾呢?

幸運(yùn)的是,我們雖然無(wú)法獲取到非常精準(zhǔn)的病變區(qū)域標(biāo)注影像,卻能夠相對(duì)容易地知道一張圖像是否包含癌癥,因?yàn)橹恍枰±龑?duì)應(yīng)關(guān)聯(lián)起來(lái)就好了。這樣一來(lái),我們可以更容易地得到圖像全局的標(biāo)簽。

如果一張圖像包含了癌癥,必然會(huì)有一個(gè)或幾個(gè)區(qū)域包含了癌癥的特征。也就是說(shuō),如果我們把圖像切分成幾個(gè)patch,必然會(huì)有某個(gè)或某幾個(gè)patch包含癌癥特征。基于這樣一種思路,我們采取了多序列的學(xué)習(xí)方式。這個(gè)方法的內(nèi)在思想很簡(jiǎn)單,就是把圖像切分成若干個(gè)patch,然后對(duì)每個(gè)patch建模,判別這個(gè)patch發(fā)生癌癥的概率。我們最后把所有patch里面癌癥概率最高的那塊,作為圖像是否包含癌癥的標(biāo)簽。

做的過(guò)程當(dāng)中,我們會(huì)逐漸積累精準(zhǔn)標(biāo)注的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)非常少,不足以虛擬一個(gè)模型。但圖像中的特征都是最精準(zhǔn)的,是經(jīng)過(guò)人為校驗(yàn)和標(biāo)注的。我們?cè)鯓硬拍馨堰@種少量的、精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)強(qiáng)化到癌癥識(shí)別中去呢?這是個(gè)非常有意思的問(wèn)題,如果能解決這個(gè)問(wèn)題,即使只有少量標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù),我們也能不斷提升。這里主要采用了多任務(wù)學(xué)習(xí)的方法,這個(gè)方法需要完成兩個(gè)任務(wù):

基于有病變區(qū)域標(biāo)注的數(shù)據(jù)建立有監(jiān)督的學(xué)習(xí)任務(wù);對(duì)于沒(méi)有病變區(qū)域標(biāo)注的數(shù)據(jù),建立前面提到的多序列學(xué)習(xí)任務(wù)。這兩個(gè)模型共享特征提取網(wǎng)絡(luò),特征提取網(wǎng)絡(luò)必須同時(shí)滿足兩大任務(wù),這樣才能把精準(zhǔn)標(biāo)注的特征強(qiáng)化到癌癥識(shí)別中去。

輔助診斷的目的是什么呢?我們希望機(jī)器最終能夠像臨床醫(yī)生一樣具備診斷疾病的能力。在介紹輔助診斷項(xiàng)目之前,我們先來(lái)看看一個(gè)醫(yī)生或者一個(gè)普通的學(xué)生是如何成長(zhǎng)為一名專家的:一個(gè)學(xué)生從剛?cè)雽W(xué)開(kāi)始,學(xué)習(xí)了大量專業(yè)課程,閱讀了大量專業(yè)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)后,就可以積累一定程度的醫(yī)學(xué)知識(shí)。當(dāng)醫(yī)學(xué)知識(shí)達(dá)到一定程度之后,就可以去醫(yī)院里面實(shí)習(xí),由臨床醫(yī)生結(jié)合一些真實(shí)案例,指導(dǎo)他去學(xué)習(xí)診斷的技能。

醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜的構(gòu)建,也就是機(jī)器學(xué)習(xí)知識(shí)的過(guò)程;有了知識(shí)之后學(xué)習(xí)診斷的能力,也就是建立疾病判別的一些模型;讓機(jī)器在與專家的博弈過(guò)程中,不斷提升診斷水平,逐漸逼近甚至超過(guò)專家。醫(yī)療知識(shí)圖譜的構(gòu)建過(guò)程中,我們首先要對(duì)文本數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。文本數(shù)據(jù)分成兩類,一類是半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),一類是非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)。

我們可以把病史分為幾個(gè)部分:疾病的情況、入院的治療經(jīng)過(guò)、入院的依據(jù)等;把病史分為這樣幾部分信息后,再對(duì)每一類信息進(jìn)行細(xì)化和提?。唤?jīng)過(guò)提取之后,非結(jié)構(gòu)化的文本就變成了計(jì)算機(jī)能夠理解的結(jié)構(gòu)化文本;我們會(huì)把這些信息轉(zhuǎn)化為醫(yī)學(xué)知識(shí)圖譜存在電腦里,于是計(jì)算機(jī)就把這個(gè)知識(shí)學(xué)會(huì)了。

診斷的過(guò)程是這樣的,首先把一段人類語(yǔ)言描述的病情轉(zhuǎn)化成計(jì)算機(jī)可以理解的結(jié)構(gòu)化知識(shí)。有了結(jié)構(gòu)化的知識(shí)以后,機(jī)器就能理解這個(gè)人的情況,把知識(shí)推送到疾病診斷模型當(dāng)中,模型將給出一個(gè)疾病列表,診斷模型的流程大致就是這樣。

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