挑戰(zhàn) ：美國農業(yè)部的研究人員需要分子生物學家和統(tǒng)計學家共同進行研究項目，領域涉及解決作物產量，人體營養(yǎng)以及環(huán)境問題的有效途徑。

解決方案 ：來自SAS公司的全新生命科學軟件 JMP Genomics不僅提供強大的海量數據分析能力，而且僅通過點擊鼠標點擊就可實現的數據可視化，使得非統(tǒng)計專業(yè)的人員容易使用和理解。

效果 ：美國農業(yè)部的研究中心廣泛地運用JMP Genomics，范圍遍及25個州。

戴比博伊工作在數字的世界中。作為地區(qū)統(tǒng)計員為美國農業(yè)部的農業(yè)研究服務(USDA)，她幫助美國農業(yè)部的研究人員設計實驗，分析結果并將這些結果轉換為統(tǒng)計學相關的格式。

博伊所在研究所位于密西西比州的斯德維爾，杰克遜西北方向兩小時車程，她與美國南部五個州的超過250名科學家合作，研究領域包括作物的產量、蜜蜂的行為、流體沉淀以及特定食物的營養(yǎng)價值等等。曾經有三位統(tǒng)計學家一起服務與她所負責的地區(qū)，包括肯塔基州、田納西州、阿拉巴馬州、密西西比州和路易斯安那州?，F在，她是團隊中唯一的統(tǒng)計師。她解釋說：“在她所在組的分子生物學家必須能夠親自做許多工作。”

JMP Genomics的產品經理香農.康納斯說：“來自SAS公司的JMP Genomics軟件是為了便于研究人員和統(tǒng)計人員一起高效地工作而設計的。通過提供菜單驅動的JMP界面與SAS連接，JMP Genomics提供的先進分析方法，交互式圖形，實驗設計工具吸引著它們所支持的生物統(tǒng)計學家和分子生物學家。”

美國農業(yè)部一直依靠SAS®軟件，因其強大的數據分析能力。2006年初SAS推出了應用于基因研究的桌面可視化軟件JMP Genomics。九月，美國農業(yè)部就購買了30套軟件，廣泛的被緬因州、明尼蘇達州、密西西比州等25個州的研究人員所使用。

JMP Genomics的學習曲線確定臨床基因研究數據的最優(yōu)預測模型

JMP Genomics采用業(yè)界領先的SAS 數據分析能力，專門針對大型基因陣列，蛋白質組學和遺傳學數據集處理而設計的。它的菜單驅動系統(tǒng)便于沒有SAS編程經驗的科學家獲取強大的SAS分析過程。此外，JMP Genomics平臺的靈活框架，允許統(tǒng)計學家使用JMP菜單運行他們自己定制的SAS程序來完成特定的任務，研究人員可以利用先進的JMP數據可視化工具以及作為研究核心的基因陣列分析所需的特定工具。

JMP Genomics可視化的基因圖譜

例如，美國農業(yè)部的科學家們研究黃曲霉病原真菌與玉米品系的相互作用。感染黃曲霉真菌的玉米株可產生黃曲霉毒素污染的糧食。黃曲霉毒素是一個強力的毒性化合物，必須控制來保證糧食及其副產品為人類和動物食用是安全的。研究人員在兩個層次上研究這個問題：為什么某些玉米品種更耐黃曲霉感染，以及確定黃曲霉與植物如何相互影響。利用基因陣列分析，生物學家通過對比病變與正常細胞的基因組合，來識別研究問題相關的基因。目標是建立更好的育種策略，既避免更多的玉米品種，又能控制病原菌。

“如果他們能找到特定基因，他們知道在DNA的位置，那么植物育種員和分子生物學家可以把抗性品種的特定基因導入高產品種”，博伊解釋。“將個別品種種植到成熟需要幾年的時間，取而代之的是你可以通過檢查DNA就能確認具有良好的基因的植物，從而淘汰那些不具備良好基因的品種。”

JMP Genomics火山圖有效地識別存在顯著差異的基因序列

在過去，博伊試圖將四或五個不同類型的軟件整合。然而，對于美國農業(yè)部的研究項目，常見的問題是，技術上缺乏足夠的分析工具，無法處理大型數據集，她解釋說：“從一個軟件平臺切換到另一個，不只是操作不順暢，而且耗費很多時間。”

JMP Genomics為簡化工作流程而設計，康納斯提道：“它提供的數據處理能力能應對基因研究的非常大的數據集，而且圖形可視化的工具使得很容易地發(fā)現數據潛在的規(guī)律。”

隨著基因科學的進步，美國農業(yè)部以及更廣泛科研領域的研究探索不斷加快。美國農業(yè)部與博伊一起的科學家們已經做好準備迎接挑戰(zhàn)。畢竟，在科學界，眼見為實。