性能方面，區(qū)塊鏈的性能和可擴展性尚有限。在區(qū)塊鏈中，交易只能排隊按序處理，所有交易結果和支付記錄都要同步到全網(wǎng)節(jié)點，嚴重影響了系統(tǒng)處理性能（在生產(chǎn)環(huán)境中，區(qū)塊鏈系統(tǒng)每秒可處理逾千筆交易；實驗室理想環(huán)境中，每秒交易量可能過萬筆）。隨著參與節(jié)點數(shù)量的增加，數(shù)據(jù)同步、驗證的開銷增多，系統(tǒng)的性能會進一步降低，從而影響區(qū)塊鏈的可擴展性。

安全方面，區(qū)塊鏈缺乏體系化安全防護。一是區(qū)塊鏈普遍采用國際通用的密碼算法、虛擬機、智能合約等核心構件，這些構件并非完全自主可控，增加了受攻擊的風險。二是區(qū)塊鏈存在內(nèi)生的安全缺陷，也就是51%攻擊問題（即通過掌握51%的算力重寫區(qū)塊鏈數(shù)據(jù)。下文提及51%攻擊時，都是指基于算力、權益證明類共識算法的區(qū)塊鏈）。三是區(qū)塊鏈仍處于早期階段，在安全方面可能存在未知漏洞。傳統(tǒng)系統(tǒng)出現(xiàn)安全問題時，可采用取消、撤回、緊急干預甚至停止服務等手段。但區(qū)塊鏈并不支持取消、撤回等相關操作。

存儲方面，全量備份的存儲機制容易遇到存儲瓶頸。區(qū)塊鏈的每個節(jié)點需存儲完整的歷史交易信息，當將區(qū)塊鏈用于零售支付系統(tǒng)時，節(jié)點存儲量將瞬時巨量膨脹。例如，2019年“雙十一”，網(wǎng)聯(lián)處理業(yè)務峰值為每秒7.15萬筆，一些簡易設備無法滿足節(jié)點的存儲需求。

交互方面，不同區(qū)塊鏈系統(tǒng)的交互性問題難以解決。目前，相同類型的區(qū)塊鏈之間依托定制的通信協(xié)議，可以實現(xiàn)數(shù)據(jù)的相互讀取、驗證和操作。但是，不同類型的區(qū)塊鏈之間，由于編程語言、數(shù)據(jù)字典、系統(tǒng)接口、智能合約等不一致，跨鏈數(shù)據(jù)難互通，容易導致業(yè)務割裂。

運維方面，業(yè)務連續(xù)性的問題不容小覷。多方集體維護的區(qū)塊鏈系統(tǒng)也會帶來巨大挑戰(zhàn)。例如，成員加入/退出、系統(tǒng)升級、業(yè)務規(guī)則更新等，目前尚缺乏成熟的標準、制度和操作規(guī)范，需要多方線下溝通才能處理鏈上的協(xié)同治理問題。

合規(guī)方面，區(qū)塊鏈無法保證結算最終性。由于存在51%攻擊等問題，基于區(qū)塊鏈的支付系統(tǒng)無法保證結算最終性?；趨^(qū)塊鏈構建支付系統(tǒng)時，需考慮是否滿足《金融市場基礎設施原則》（PFMI）的要求，以免產(chǎn)生法律風險。

職能方面，區(qū)塊鏈的去中心化性特性與中央銀行的集中管理要求存在沖突。中央銀行提供的支付服務不能離開集中式賬戶安排，需建立在中心化系統(tǒng)之上，這和區(qū)塊鏈的去中心化特性相沖突。因此，目前不建議基于區(qū)塊鏈改造傳統(tǒng)支付系統(tǒng)。