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[導讀] 據(jù)報導,麻省理工學院(MIT)成立藥物研發(fā)合成之機器學習協(xié)會(MLPDS),試圖改變藥物研發(fā)制造流程,目前已有8個產(chǎn)業(yè)合作伙伴,皆為制藥領域龍頭,包括Amgen、BASF、Bayer、Lilly

據(jù)報導,麻省理工學院(MIT)成立藥物研發(fā)合成之機器學習協(xié)會(MLPDS),試圖改變藥物研發(fā)制造流程,目前已有8個產(chǎn)業(yè)合作伙伴,皆為制藥領域龍頭,包括Amgen、BASF、Bayer、Lilly、NovarTIs、Pfizer、Sunovion和WuXi等。

藥物研發(fā)所費不貲又耗時,但機器學習可望分析大量化學資料,提高研發(fā)效率,對于研發(fā)流程和結果皆有幫助。MLPDS協(xié)會將結合MIT研究團隊和產(chǎn)業(yè)的力量,首要目標是把機器學習引進藥物研發(fā)流程中。

2018年4月時,MIT舉辦高峰會,由計算機科學教授Regina Barzilay和電子工程教授Erna Viterbi等人領軍,召集MIT研究者以及科技、生技和管制單位的龍頭,探討如何以數(shù)碼科技和人工智能(AI)克服生物醫(yī)療和醫(yī)療照護的重大挑戰(zhàn)。

MLPDS協(xié)會起初受到美國國防高等研究計畫署(DARPA)Make-It計畫所資助,目標是以機器學習和自動系統(tǒng)來合成藥物,先后于2017年5月和9月跟制藥產(chǎn)業(yè)的企業(yè)代表會商,無論產(chǎn)業(yè)界或MIT皆有濃厚興趣展開合作。

材料科學工程教授Klavs Jensen表示,合作廠商滿懷熱忱,加上機器學習技術潛力無限,這些將是化學和制藥產(chǎn)業(yè)科學家的強力后盾,機器學習有助于規(guī)劃化學合成路徑,帶領我們探索新的化學領域,提升化學的多樣性,將更有機會找出具備特殊功能的化合物。

2018年5月MLPDS協(xié)會再度聚集產(chǎn)業(yè)合作伙伴,透過教學和合作研究計畫,讓他們對于機器學習有基本概念。Barzilay為大家講授基礎的監(jiān)督式學習(supervised learning),亦即機器學習的其中一種方法,也涵蓋神經(jīng)模型和表征學習(representaTIon learning)。

Barzilay表示,只是剛開始探索這個新領域,但未來潛力無窮,可望改善人們的生活,這次跟制藥產(chǎn)業(yè)合作,相信會是合作順利的關鍵,他向來從產(chǎn)業(yè)界獲益良多,發(fā)現(xiàn)不少值得思考的新問題。

協(xié)會的目標之一是建立評估標準和標竿資料集,以確認機器學習方法的準確度,目前大多數(shù)研究團隊都是基于內(nèi)部資料集來進行評估,有礙不同模型之間互相比較,進而拖慢科學進程,更糟糕的是,公開資料及通常無法呈現(xiàn)制藥研究所面對的復雜性。

MIT透過新協(xié)會進行跨領域合作,包括機器學習、化學和化學工程等。這對于新科技的研究者和使用者都有好處,有助于了解目前的發(fā)展程度,以及機器學習新科技的發(fā)展?jié)摿?。Jaakkola也表示,結合現(xiàn)代機器學習技術和化學知識,可望開啟藥物研發(fā)、改良和合成的新途徑。

化學工程研究生Connor Coley表示,雖然藥物合成規(guī)劃軟件由來已久,但仍未獲得廣泛采用,合成規(guī)劃對于初期藥物研發(fā)階段至關重要,可快速發(fā)現(xiàn)新的合成策略,減少反復研發(fā)、合成、測試的時間。

合作廠商也看好機器學習技術的潛力,Amgen的Shawn Walker表示,機器學習可望加速藥物研發(fā),更快速把新藥交到病患手上。諾瓦德氏生物醫(yī)療研究機構(NIBR)表示,他們很期待加入MIT所成立的新協(xié)會,可望加速制作更安全而有效的藥物。

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